相分離/相變

（Phase separation，Phase Transition）

相分離/相變是近幾年生化、細(xì)胞生物學(xué)新興且十分火熱的研究領(lǐng)域。Hyman和Brangwynne 2009年在Science發(fā)表了題為：Germline P granules are liquid droplets that localize by controlled dissolution/condensation 的文章，提出了細(xì)胞內(nèi)通過(guò)“相分離"，可以提供一種特定的方式讓細(xì)胞內(nèi)的特定分子聚集起來(lái)，從而在“混亂的"細(xì)胞內(nèi)部形成一定“秩序"，為困擾了大家多年的問(wèn)題，提供了全新的思路。
 

分離或相變（Phase separation，Phase transition）描述的是細(xì)胞里不同成分間相互碰撞、融合形成液滴，從而使一些成分被包裹在液滴內(nèi)、一些成分被阻隔在液滴外的現(xiàn)象，就如同水油相混，細(xì)胞里的不同成分也會(huì)相互分離，形成液滴，這就是相分離。后續(xù)的大量研究也讓生物學(xué)家發(fā)現(xiàn)相分離在細(xì)胞生物學(xué)中無(wú)處不在。2011年，Hyman, Mitchison 和 Brangwynne又發(fā)現(xiàn)核仁有液滴現(xiàn)象，后續(xù)研究相繼發(fā)現(xiàn)RNA和蛋白質(zhì)分子間存在較弱的作用力，形成液滴類的物質(zhì)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)存在相分離現(xiàn)象；至2018年CNS上已發(fā)表十幾篇重要級(jí)文章證實(shí)相分離的廣泛存在和重要性。
 

圖1. 細(xì)胞內(nèi)的油滴藝術(shù) 
 

細(xì)胞內(nèi)的相分離

細(xì)胞中存在各種無(wú)膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞器：顆粒、核仁、Cajal bodies、stress granules、miRISC及突觸的細(xì)胞骨架等，相分離廣泛發(fā)生于各種成分之間。
 

蛋白質(zhì)或RNA分子

蛋白質(zhì)或RNA分子間的物理作用力可以使它們相互分開(kāi)或聚集。一旦分子達(dá)到一定濃度，它們就會(huì)發(fā)生相分離，相似的成分聚集在一起加速生物學(xué)反應(yīng)（類似于相似相容），或者隔離無(wú)關(guān)的分子。
 

細(xì)胞膜上的信號(hào)傳遞

在神經(jīng)細(xì)胞中，細(xì)胞間進(jìn)行信號(hào)傳遞時(shí)，蛋白質(zhì)在連接處的聚集和相分離是保證細(xì)胞間信號(hào)傳遞正常進(jìn)行所必需的。
 

DNA折疊包裝

在細(xì)胞核中，相分離幫助壓縮折疊不使用的DNA并抑制其活性。一些可能與轉(zhuǎn)錄相關(guān)的蛋白被阻隔在外。
 

液滴成為障礙 

在肌萎性脊髓側(cè)索硬化癥中，分離成液滴的蛋白質(zhì)會(huì)逐漸凝結(jié)、變硬，形成有害的固體物質(zhì)。

圖2. 細(xì)胞內(nèi)的相分離

相分離的主要應(yīng)用

隨著相分離的研究逐漸增多，研究人員發(fā)現(xiàn)相分離在無(wú)膜器官的形成、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞骨架、超分子組裝、基因激活等方面起著重要作用，相分離異?？赡軐?dǎo)致如神經(jīng)退行性疾病、腫瘤、衰老等。
 

神經(jīng)退行性疾病

在肌萎側(cè)索硬化（ALS） （一種運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元疾?。?中觀察到“相分離"，發(fā)現(xiàn)FUS蛋白和hnRNPA1在ALS中形成液滴，液滴粘性逐漸變強(qiáng)，最終形成纖維狀的固體，在ALS中異常沉積。
 

阿爾茨海默病患者腦內(nèi)異常沉積的tau蛋白也存在相分離，相分離可能是tau蛋白聚集的初始觸發(fā)因素。

圖3. FUS蛋白相分離作用圖解；FUS蛋白相分離熒光圖像
 

腫瘤

分子病理學(xué)家Miguel Rivera和他的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了一種與尤文氏肉瘤有關(guān)的蛋白。這種蛋白聚集在與腫瘤發(fā)生相關(guān)的基因組附近時(shí)可激活致癌基因表達(dá)，而異常的相分離就可能促使這種蛋白在這些區(qū)域附近聚集。
 

細(xì)胞保護(hù)作用

Hyman和Alberti發(fā)現(xiàn)酵母細(xì)胞在低pH的壓力環(huán)境下，一些重要蛋白會(huì)聚集成液滴啟動(dòng)保護(hù)機(jī)制。當(dāng)pH回升后，這些液滴會(huì)分散開(kāi)，細(xì)胞恢復(fù)正常的功能。
 

相分離研究中使用的主要技術(shù)

研究相分離涉及的相關(guān)步驟及技術(shù)有很多，首先通常會(huì)用到體外重構(gòu)相分離，通過(guò)將目標(biāo)物質(zhì)表達(dá)純化，在體外重構(gòu)相分離的過(guò)程，證明存在相分離機(jī)制。其次，相分離研究的關(guān)鍵是要證明所研究的目標(biāo)物質(zhì)（蛋白、RNA等）存在動(dòng)態(tài)可逆的聚集-解聚狀態(tài)變化，并且這一變化與目標(biāo)物質(zhì)的功能有關(guān)。因此如何證明這種動(dòng)態(tài)變化狀態(tài)是關(guān)鍵。
 

這一過(guò)程包括觀察相分離的技術(shù)以及影響和調(diào)控相分離過(guò)程的技術(shù)，如：顯微成像技術(shù)、光調(diào)控系統(tǒng)（OptoDroplets、CasDrop）、溶液渾濁度檢測(cè)、離心沉淀法、表面張力測(cè)定（反毛細(xì)管速度+被動(dòng)微流變學(xué)）、液滴內(nèi)部硬度測(cè)定（原子力顯微鏡或光鑷）、聚合物網(wǎng)格孔徑測(cè)定（熒光標(biāo)記右旋糖苷）等。
 

顯微成像作為觀察相分離的主要技術(shù)，在相分離中發(fā)揮著*的作用。按觀察方式主要涉及明場(chǎng)光學(xué)顯微鏡和熒光顯微鏡。明場(chǎng)顯微鏡中主要通過(guò)微分干涉（DIC）、相差（PH）、偏光（POL）等方法觀察體外、無(wú)標(biāo)記的相分離溶液，可獲得液滴形成過(guò)程、大小及隨時(shí)間變化、液滴內(nèi)部纖維性或固態(tài)樣結(jié)構(gòu)各項(xiàng)異性等結(jié)果。對(duì)于體外和體內(nèi)熒光標(biāo)記的研究對(duì)象，則采用熒光顯微鏡去觀察并獲取高分辨的液滴形成過(guò)程、大小及隨時(shí)間變化的熒光圖像，以及分子擴(kuò)散性和液滴內(nèi)部分子擴(kuò)散能力等研究。
 

明場(chǎng)顯微鏡

運(yùn)用明場(chǎng)顯微鏡DIC或者PH的功能，可以獲得：

• 液-液相分離形成的液滴，得到形成時(shí)間、輪廓大小、融合或裂變擴(kuò)散等信息；

• 隨著加入藥物處理，可觀察液滴大小變化、融合或者裂變擴(kuò)散。

如圖4，在DIC明場(chǎng)顯微鏡模式下觀察隨時(shí)間變化，液滴形態(tài)大小的變化。

圖4. DIC明場(chǎng)顯微鏡觀察相分離隨時(shí)間的變化過(guò)程 
 

熒光顯微鏡

因其分辨率高，能夠清晰觀察靜態(tài)液滴輪廓邊界以及亞細(xì)胞的分子結(jié)構(gòu)（如圖5），對(duì)于動(dòng)態(tài)過(guò)程的采集，也能獲取更為清晰的圖像，是相分離成像的主要觀察手段。

圖5. 小鼠胚胎干細(xì)胞相分離免疫熒光圖像
 

圖6. HeLa細(xì)胞核中蛋白聚集、分離形成小液滴
 

激光共聚焦顯微鏡

除了上述檢測(cè)液滴輪廓、大小，融合裂變、分子結(jié)構(gòu)、定位等實(shí)驗(yàn)外，在激光掃描共聚焦顯微鏡上還可以進(jìn)一步利用熒光漂白后恢復(fù)實(shí)驗(yàn)（FRAP）檢測(cè)液滴中的擴(kuò)散行為。FRAP實(shí)驗(yàn)原理是使用高強(qiáng)度激光將對(duì)選定區(qū)域進(jìn)行漂白，然后觀測(cè)該區(qū)域熒光強(qiáng)度隨時(shí)間恢復(fù)的動(dòng)力學(xué)過(guò)程。FRAP是非常有效的研究分子動(dòng)力學(xué)變化的技術(shù)手段，它可檢測(cè)體外和體內(nèi)的相分離、可評(píng)估液滴內(nèi)部的同質(zhì)性，具備激光功率可控、靈活照明控制、靈活選擇漂白區(qū)域等*優(yōu)勢(shì)，在相分離研究中能發(fā)揮重要作用。基于共聚焦顯微鏡的FRAP實(shí)驗(yàn)除了可以獲取高分辨圖像，還能獲取動(dòng)態(tài)的漂白恢復(fù)曲線信息（如圖7），更好地評(píng)估相分離中的動(dòng)力學(xué)過(guò)程。

圖7. 基于激光共聚焦顯微鏡的FRAP實(shí)驗(yàn)研究相分離
 

如需觀察更為微觀的納米結(jié)構(gòu)，可以使用超高分辨共聚焦顯微鏡，實(shí)現(xiàn)50nm的解析精度，也可使用電子顯微鏡做進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)分析。